常見問題
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16S rDNA是原核生物核糖體小亞基的組成部分，包含10個(gè)保守區(qū)域（Conserved Regions）和9個(gè)高變區(qū)域（Hypervariable Regions），其中，保守區(qū)為細(xì)菌共有，而高變區(qū)具有種屬特異性，其基因序列隨親緣關(guān)系不同而有一定的差異。因此，16S rDNA可以作為揭示生物物種的特征核酸序列，是細(xì)菌系統(tǒng)發(fā)育和分類鑒定的指標(biāo)。16S rDNA擴(kuò)增子測序技術(shù)是研究環(huán)境樣品中微生物群落組成結(jié)構(gòu)的重要手段。
18S rDNA則是真核生物核糖體小亞基的組成部分，與16S rDNA類似，其序列中的高變序列區(qū)域能體現(xiàn)物種間的差異。對(duì)微生物群落進(jìn)行分析時(shí)，16S rDNA主要用于原核生物多樣性的鑒定，而18S rDNA則主要用于真核微生物（原生動(dòng)物、藻類、真菌等）多樣性的鑒定，根據(jù)研究需求的不同，可以選擇不同的擴(kuò)增區(qū)域進(jìn)行研究。
18S rDNA則是真核生物核糖體小亞基的組成部分，與16S rDNA類似，其序列中的高變序列區(qū)域能體現(xiàn)物種間的差異。對(duì)微生物群落進(jìn)行分析時(shí)，16S rDNA主要用于原核生物多樣性的鑒定，而18S rDNA則主要用于真核微生物（原生動(dòng)物、藻類、真菌等）多樣性的鑒定，根據(jù)研究需求的不同，可以選擇不同的擴(kuò)增區(qū)域進(jìn)行研究。
16S rDNA 區(qū)域測序及引物選擇
18S rDNA區(qū)域測序及引物選擇
ITS區(qū)域測序及引物選擇
18S rDNA區(qū)域測序及引物選擇
ITS區(qū)域測序及引物選擇
微生物幾乎存在于地球的每一個(gè)角落之中，從人體腸道，到人類生存所必須依賴的空氣，再到火山等高溫極端環(huán)境，都可以見到它們的身影。通過16S rDNA/18S rDNA/ITS測序，我們可以對(duì)環(huán)境中的優(yōu)勢物種、稀有物種及一些未知物種同時(shí)進(jìn)行檢測，獲得環(huán)境中微生物群落組成及相對(duì)豐度，這對(duì)研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、微生物與人體的關(guān)系，以及微生物資源的利用等有著重要的理論和現(xiàn)實(shí)意義。
微生物多樣性研究可以應(yīng)用在人體醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)、工業(yè)、環(huán)境治理、生物能源等諸多領(lǐng)域。在人體醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，通過比較正常和疾病狀態(tài)下的微生物群落結(jié)構(gòu)和功能變化，對(duì)微生物群落多樣性進(jìn)行比較分析，可以獲得人體微生物群落變化同疾病之間的關(guān)系，為后續(xù)疾病預(yù)防檢測及治療提供理論基礎(chǔ)；而在環(huán)境領(lǐng)域中，高通量測序技術(shù)的成熟和普及，使我們能夠?qū)Νh(huán)境微生物進(jìn)行深度測序，靈敏地探測出環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)隨外界環(huán)境的改變而發(fā)生的變化，從而為我們研究微生物與環(huán)境的關(guān)系、治理環(huán)境和利用微生物資源提供理論指導(dǎo)。
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